小說《在海底逃亡》講述的是一個發生在深海之中的驚險故事，圍繞著主角在海底的艱難生存和逃亡而展開。
故事的主角是一位年輕的海洋生物學家，名叫林遙。她從小就對海洋充滿了熱愛，夢想著能在大海中探索未知的生物和生態。然而，她的使命不僅僅是研究與探索。一次意外的實驗室爆炸，讓她卷入了一個陰謀之中，被迫到達了一個名為“深海研究站”的秘密設施。
深海研究站位于離岸邊數百公里的地方，一旦手中的小舟被潮水推向深海，便再也沒有回頭路。這里是被政府掩蓋的一個實驗室，研究著各種對人類未知的海洋生物，以及一些不為人知的秘密。林遙被迫成為這里的一名研究員，參與一些讓她無法接受的實驗。她目睹了殘忍的實驗過程，以及對海洋生物的無情對待。她渴望逃離，但卻又無從下手。
在研究站中，林遙交到了幾個志同道合的朋友。包括同為研究員的李風，他是一位沉穩冷靜的人，對海洋生物的熱愛與林遙不謀而合；還有一位名叫小白的年輕實習生，他天真無邪，天生對大海充滿了好奇。三人相互扶持，暗暗地策劃著逃離的計劃。
隨著時間的推移，林遙越來越清楚，深海研究站里一切的秘密都與一項被稱為“海底網”的計劃有關。這項計劃旨在利用海洋生物進行基因改造，以尋求更高效的能源和其他用途。每當夜晚來臨，林遙便會在宿舍的窗邊望向深邃的海洋，心中充滿了對自由的渴望。
終于，某一天，林遙與李風、小白決定付諸行動。他們找到了通往實習生區和實驗室之間秘密通道的入口，計劃趁夜潛入實驗室，尋找能夠幫助他們逃出研究站的工具和資料。然而，事情并沒有他們想象中的順利，實驗室的安保異常嚴密，幾次都差點被發現。
經過幾天的探查，他們終于發現了一個隱藏的出口，通向海底的一條自然裂縫，那里是他們逃離的關鍵。第一晚，他們開始行動。在月光的照耀下，海面泛起微微的漣漪，仿佛在為他們的計劃默默祝福。他們帶上了準備好的潛水裝備，毅然決然地朝著裂縫游去。
下潛的過程中，幾乎每一米都讓他們感到窒息，深海的陰冷讓人心驚。然而，林遙和朋友們互相鼓勵，堅定著目標。在抵達裂縫時，他們才發現這里的水流極為湍急，水壓更是讓人感到如蝶翼般的沉重。就當他們猶豫不決時，林遙忽然想起了自己在深海潛水時所學到的技巧，指引著隊友們選擇正確的方向。
終于，他們快速穿過了裂縫，出現在一片神秘的海底景觀之中。五彩斑斕的珊瑚、形狀各異的海洋生物，仿佛讓他們置身于另一個天地。三人心中既興奮又緊張，但他們知道，自己還有更重要的事情要做。他們趕緊尋找離開這里的道路。
在他們游向上方水域的過程中，忽然被一群涌動的魚群包圍。出乎意料的是，這些本該是他們的敵人的生物卻與他們心有靈犀，仿佛在護航一般，任憑他們穿梭其中。林遙心中不禁有些感動，似乎這些海洋生物也在呼應著他們的自由之路。
終于，他們浮出水面，在一片未知的海域中來到了一個小島。島上的風景如畫，陽光灑落在白色的沙灘上，陣陣海浪拍打著岸邊。林遙長長地舒了一口氣，終于逃離了那個陰暗的深海研究站。
在小島上，他們靜靜地休息，思考著未來的路。林遙想起了海洋生物的美麗與神秘，也回想起在研究站中的艱難與斗爭。雖然逃離似乎是結束，但對她而言，更是新的開始。她希望能夠將這個秘密公諸于世，揭露那些不為人知的黑暗，守護這片深海的生物朋友。林遙與朋友們重新聚集在一起，踏上了一個全新的旅程，既是逃離，也是希望的開始。
海風輕輕拂過，林遙看著海面上的波光，眼中滿是堅定與勇氣。這片浩瀚的海洋不僅僅是她的研究領域，更是她心靈深處的歸屬。她知道，自己的冒險才剛剛開始。