《異世毒醫》講述了一個現代藥劑師穿越到一個以武道和煉藥為主的奇幻世界的故事。主角清風，憑借他豐富的醫學知識和對毒藥的獨特理解，逐漸在這個異世闖出了一片天地。在他所處的世界中，修煉和煉藥是每個人追求的目標，尤其是那些擁有稀有天賦的人，更是在各大宗門和世家爭相追逐的對象。
故事開始，清風在一次實驗中誤觸了一個神秘的儀器，瞬間被卷入了時空的漩渦，醒來時已身處一個陌生的地方。他面前是一片青山綠水，鳥語花香。初見這個世界的他，既感到驚奇又感到不安。環顧四周，他意識到自己無法回到了現代，于是決定在這個新世界里生存下去。
清風很快被村子里的百姓接受，因為他那過人的醫術和對草藥的了解。每當有人生病或受傷，他總能迅速施救，村民們對他格外感激。然而，清風并不滿足于此，他想要學會這個世界的武道和煉藥，以便更有效地幫助他人。于是，他開始向村里一位年長的煉藥師請教，學習煉藥的基礎知識。
在無數個日日夜夜的努力下，清風不僅掌握了煉藥的基本技巧，還在實驗中大膽創新，成功調制出一些強效的藥劑，引起了煉藥師和武者們的注意。隨著名聲的傳播，清風受到了一家大型宗門的邀約，希望他能夠加入。面對如此誘人的機會，他心中既興奮又忐忑。
在宗門中，清風結識了許多志同道合的朋友，其中有一位天資聰穎的少女名叫明雪。她不僅容貌出眾，更是煉藥天才，二人一見如故，共同研究藥劑和武道，成為了彼此的最佳拍檔。明雪的聰慧和清風的經驗相得益彰，他們的組合在宗門內外引起了廣泛關注。
雖然清風在宗門的日子過得豐富多彩，但他心里始終記掛著當初離開時的愿望——回到現代。因此，他的煉藥研究始終緊密圍繞著希望找到返回的方法。經過無數次失敗與實驗，他逐漸掌握了一些可以追溯過去的秘訣，并在此過程中發現了一種強大的藥劑，可以開啟時空之門。
然而，隨著清風在宗門內的聲望越來越高，他也引來了不少嫉妒與敵意。一些宗門內的修士開始暗中針對他，企圖削弱他的影響。清風并不知道，這些人企圖借助他的藥劑來實現自己的野心，從而引發一系列的陰謀與斗爭。
在一次藥劑大賽上，清風憑借其卓越的表現贏得了冠軍，但隨之而來的不僅是榮譽，還有接踵而至的危機。一種被他無意中觸碰的劇毒藥劑引發了騷動，宗門內外紛紛傳聞，指責他是毒醫，甚至有人在暗中試圖置他于死地。
面臨重重威脅，清風不得不開始反擊。他利用自創的藥劑和豐富的醫藥知識，幫助好友、師兄弟們抵御敵人，同時探尋真相。經過一番調查，清風發現這些嫉妒自身的人暗中勾結，企圖通過陷害來奪取他的藥劑秘方和研究成果。
清風決定孤注一擲，憑借自己對毒藥的深厚理解，親自設計了一道致命的藥劑陣。他在一次家族聚會上，面對敵手，巧妙地利用毒藥反制了那些陰險的對手，揭示了他們的真面目，最終將他們一一擊退。
隨著敵人的消失，清風不僅捍衛了自己的名聲，更贏得了眾多修士的尊重和信任。他開始將自己的醫術與藥劑知識傳授給更多的人，為這個世界培養更多優秀的煉藥師和武者。
經過這一系列的波折，清風徹底放下了回歸現代的念頭。他意識到，自己不僅在這里找到了事業和友誼，更是擁有了一個可以施展才華、幫助他人的舞臺。最終，他在這個異世扎根，成為了一名享譽四方的毒醫，幫助鄉民們解決疾病和困擾。
在清風的堅持與努力下，這個世界的醫藥水平有了長足的進步，許多曾經絕癥的病例得到治愈，民眾生活得越來越幸福。清風用自己的智慧與仁心，譜寫出一段屬于異世毒醫的不朽傳奇。至此，他的人生旅程，不再是孤獨的探索，而是與無數人同行的光輝大道。