《我把你當兄弟你卻》的故事圍繞著一個錯綜復雜的情感糾葛展開，主人公李明和他的青梅竹馬張偉從小一起長大，感情深厚。兩人原本是無話不談的兄弟，但隨著年齡的增長，微妙的變化開始悄然發生。
李明是個外向的男孩子，喜歡打籃球、交朋友，而張偉則性格內向，沉默寡言。他們的性格差異使得彼此之間的友誼顯得更加鮮明。盡管如此，李明心中始終把張偉視為最親密的兄弟，毫無保留地分享了自己的秘密與夢想。然而，李明并不知道，張偉對他的感情早已超越了兄弟的界限。
隨著高中生活的開始，李明的身邊越來越多的女生圍繞，張偉卻感到一種難以名狀的焦慮。他看到李明和那些女同學打得火熱，心里的嫉妒與失落開始悄悄滋長。一次班級聚會后，李明醉了，趴在桌子上大聲喊著：“偉，你是我最好的兄弟，永遠不分開！”那一刻，張偉心如刀割，明明如此堅定的承諾，卻是他心中最深的絕望。
在之后的日子里，張偉開始刻意疏遠李明，試圖讓自己不再過分依賴這段感情。然而，李明卻對此毫不知情，依舊熱情地尋求張偉的陪伴。面對李明的熱情，張偉的心中矛盾糾結，一方面想要保持這段友情，另一方面又無法抑制對李明的愛慕。
隨著時間的推移，張偉最終意識到再也無法逃避自己的感情。在一個風和日麗的下午，張偉鼓起勇氣，約李明去他們常去的籃球場。那時候，夕陽西下，余暉灑在兩人的身上，張偉感到心跳加速，幾乎要窒息。他終于忍不住開口：“明，我有話想和你說。”
李明正炫耀剛練出的投籃技巧，聽到張偉的話，停下來，轉過頭看著他，眼中閃爍著期待。“什么事？你說啊。”
張偉吞了吞口水，思緒萬千，最終極力鎮定地說道：“我……我喜歡你。”
李明愣住了，隨后苦笑一下，“偉，你知道我是直的吧，哈哈。”他以玩笑掩飾內心的震驚，但張偉卻從他眼中看到了不安。
張偉的心一下子沉到谷底，他本以為李明會理解，畢竟他們的友情如此深厚，他以為這些年間，他們之間的聯系是特別的。然而，現實的殘酷讓他無所適從。早已對李明心心念念的他，突然感到一種前所未有的孤獨。
而李明則覺得自己的生活又回到了單純的軌道，但他并不知道，張偉的心已經被撕裂。無奈的張偉決定徹底放下這份感情，開始更專注于自己的生活。他努力學習、參加社團活動，試圖用忙碌來填補心中的空虛。雖然如此，他心里始終留有一絲對李明的牽掛。
時光荏苒，高中畢業后，李明與張偉的聯系逐漸減少。李明走向了大學的校園，而張偉則選擇了一條不同的道路，進入了工作崗位。隨著生活的忙碌，兩人之間的距離似乎越來越遠，但那段友情卻始終留存在彼此心中，他們曾經的小秘密與美好回憶在腦海中反復上演。
在一次偶然的重聚中，李明發現自己對張偉的情感其實并未減少，反而在不知不覺中加深。酒桌上的幾杯酒下肚，李明終于有勇氣再次提及張偉當年的告白。他直視張偉的眼睛，認真地說：“偉，我一直把你當兄弟，但也許我可以試著更進一步。”
張偉怔了怔，眼中閃過一絲驚喜與期待，然而隨即又被往昔的回憶與傷痛淹沒。他深吸了一口氣：“明，我們能回到從前嗎？”
兩人都知道，之前的種種都無法回去，但他們心中都存有著彼此的溫暖。經過這次重聚，李明與張偉逐漸重新審視彼此的關系，開始嘗試去理解對方的心意，盡管依舊脆弱，卻也渴望著更深的連結。
最終，他們選擇將這一切理順，成為彼此生命中的支持者與陪伴者。或許，愛情有時并非只有一種形式，友誼與愛慕可以兼容并存。在未來的日子里，他們攜手并肩，共同面對生活的風雨與陽光，重建了那段曾經最純真的情感。