在一個遙遠而神秘的地方，流淌著一條名為“暗河”的河流。它的水清澈見底，卻因其中隱匿著無數的秘密而顯得神秘莫測。此地，正是《暗河長明》的故事發生之處。
故事的主人公是一個名叫林暗的年輕人。他自幼生活在一個寧靜的小村莊中，村莊被茂密的森林環繞，林暗的父親是一位著名的漁夫，常常在河中捕捉魚類供給村莊的生活。他從小耳濡目染，對河流產生了濃厚的興趣，常常在暗河邊玩耍，幻想自己能成為一個偉大的探險者。
有一天，林暗偶然間在暗河邊撿到一本破舊的書籍，封面上寫著《長明筆記》。書中的每一頁都記錄著河流的傳說，特別是古老的神靈與隱秘的河底寶藏，這激起了林暗的好奇心。他決定深入研究這本書中的內容，探索暗河的奧秘。
隨著時間推移，林暗在書中發現了幾個關于神靈的故事，其中提到一個名叫“長明”的水神，守護著這條河流的平安與繁榮。然而，書中還寫道，自從古老的祭祀儀式被遺棄后，長明水神的力量逐漸減弱，河流中的生物也因此變得不再豐富。
林暗被這個故事深深吸引，他開始著手尋找失落的祭祀儀式。他詢問村中的老人，試圖找出祭祀的細節，卻始終得不到確切的答案。于是，他決定踏上尋求真相的旅程。
他沿著河流向上游探尋，途經一個個小村莊，每到一處，林暗都會仔細詢問當地的老人，收集與暗河和長明水神相關的故事。然而，關于祭祀的記憶似乎愈發模糊，似乎在大家的記憶深處，長明水神早已成為傳說。
就在林暗快要放棄的時候，他遇到了一個神秘的老人。老人白發蒼蒼，雙眼透出智慧的光芒。林暗鼓起勇氣，向老人訴說了他的尋求。老人聞言，微微一笑，從懷中掏出一枚古老的護身符，遞給林暗。
“這是長明水神的印記，只有值得信賴的人才能獲得。若想恢復水神的力量，你需尋找三樣遺失的祭品：清泉的源頭、樹木的根和星辰的光。”
林暗心中燃起希望，立即踏上了尋找祭品的征程。他首先來到了清泉的源頭，這一處深藏在暗河的源頭，水流清澈透明，宛如明鏡。經過一番探尋，他終于在水中撿到了一個古老的石瓶，瓶內盛滿了源頭的清泉。
接著，他前往深邃的森林，尋找樹木的根。在那里，他遇見了一棵千年古樹，樹根枝繁葉茂，散發出濃郁的氣息。林暗小心翼翼地挖取了樹根的一小部分，并感謝樹木對大地的饋贈。
最后，林暗仰望星空，尋找那閃爍的星辰。他在一個開闊的高地，迎著夜空的星光，靜靜許下心愿。他相信，星辰的光輝能與水神的力量產生共鳴。在這一刻，他感受到內心的寧靜和強烈的使命感。
帶著三樣祭品，林暗回到了暗河的岸邊。他在河邊筑起一個祭壇，按照書中記載的方式，依次擺放好祭品。然后，他閉上雙眼，默念著長明水神的名字，向神靈祈禱。隨著他的禱告，一道微光從河的深處蕩漾開來，環繞在祭壇周圍。
在光芒中，林暗仿佛看見了長明水神的身影，那是一個溫柔而神秘的存在。水神的聲音在他耳邊回蕩：“感謝你，勇敢的少年，你帶回了我失去的力量。從今往后，暗河將再度繁榮，保護這片土地的人們。”
水神的召喚過后，暗河的水流變得更加湍急，魚兒們歡快地游動，河兩岸的植物也開始煥發出生機。林暗意識到，他不僅僅找到了祭品，更是恢復了人們與自然的和諧相處。
之后，林暗成為了村莊的守護者，他常常回到河邊，講述著水神的故事，傳承著古老的祭祀習俗。暗河的傳說也因他的努力而得以延續，每當河水流淌，大家都能聽到長明水神的祝福。
伴隨著時間的流逝，林暗的故事被更多的人傳頌，成為了小村莊中的傳奇，激勵著一代又一代的人去探索未知的奧秘，保護與自然的和諧。而那本《長明筆記》則成為了村莊的寶藏，啟迪著未來的探險者，延續著一段美麗的傳奇。