《死亡作業》是一部探討青春、恐懼與選擇的小說。故事的主人公是高二學生李明，一個性格內向、成績優異但缺乏自信的少年。李明的生活一直圍繞著學習、考試以及家長的期待，直到一件離奇的事件打破了他平靜的生活。
某個陰雨綿綿的下午，李明在學校圖書館偶然發現了一本破舊的手冊，封面上寫著《死亡作業》。出于好奇，他翻開了這本書，里面記錄著各種各樣的作業，這些作業不僅僅是學術性的，還有一些奇特到讓人毛骨悚然的任務，比如"在夜晚的操場獨自呆上一個小時"、"給一個同學寫封匿名信，揭露他們的秘密"等，這些作業似乎都有著神秘的力量。
起初，李明對這些作業充滿了好奇，他決定嘗試其中一個。第一個作業是"在天黑之前，向一個曾經傷害過你的人道歉"。李明選擇了他的同班同學王強，實際上王強在初中時曾因一句玩笑而無意中傷害了李明。盡管心中忐忑不安，他還是鼓起勇氣，找到了王強。在意外的道歉中，王強表現出了意想不到的反應，反而對李明表達了愧疚，兩人化解了心結，心中似乎都變得輕松了。
隨著李明不斷完成這些作業，他的生活發生了微妙的變化。他變得更加自信，社交圈也逐漸擴大，甚至得到了一些同學的認可。然而，隨著作業的深度加深，事情也開始變得復雜和陰暗。第二個作業要求他在學校的鬼屋中待上兩個小時，傳說這個鬼屋是一個淘氣的靈魂聚集地，曾經有幾個人在里面失蹤。
李明雖然內心感到恐懼，但還是決定完成這個作業。在萬分忐忑中，他在鬼屋里徘徊，周圍是一片死寂。不久后，他發現自己并不是一個人在這里，還遇到了同班的女同學小雨。她也在這里，完全是一副無所畏懼的樣子。兩人相互陪伴，共同面對幽暗的角落和突如其來的怪聲，李明感受到一種久違的安心。
然而，到了作業的最后一個階段，李明終于接到了最為艱巨的任務：他必須選擇一個人來結束他們的生涯。這個作業是對他內心道德的考驗，李明感到無比痛苦。完成這樣的任務，會讓他失去自己的靈魂，甚至走上不歸路。
李明不知道應該如何選擇，他在糾結中度過了幾天，連學習也無法集中。此時他遇見了小雨，兩人分享了各自的煩惱與恐懼。小雨的勇敢感染了李明，令他逐漸明白，人生中有些事情不僅僅是簡單的選擇，更多的是一種責任感。他意識到，每個人的生命對于他人而言都是珍貴的，他要為每一個生命負責。
最終，李明決定不去執行這個作業，而是向所有班上的同學坦白了《死亡作業》的事情。他希望大家能夠重視生活中的每一份情感，關心身邊的人，而不是無謂地追求不切實際的能力。出乎意料的是，同學們對他的勇氣給予了支持，紛紛表示愿意一起共同面對這個詭異的挑戰。
李明的決定帶動了班級的風氣，大家開始主動交流，彼此分享內心的感受，而不僅是書本上的知識。他們相約定期組織活動，讓彼此的關系更加緊密。李明逐漸變得開朗，也激勵了更多的同學勇敢表達自己，形成了良好的班級氛圍。
然而，《死亡作業》的書籍依然在圖書館的角落靜靜地等待著下一個人。李明明白，這個世界上總會有一些神秘的力量，但最重要的是他如何選擇面對，并賦予這些選擇以真正的意義。
在故事的結尾，李明站在校門口，與小雨一起望著漸漸落下的夕陽。他知道，這一天的選擇，將會影響他們未來的道路。他們的青春獨一無二，雖然有時帶著恐懼，但更多的是希望與前行的勇氣。每一個選擇都在塑造著他們的生活，而無論未來如何，他們都將攜手同行，迎接未知的每一份挑戰。