在一個被高墻圍繞的迷宮中，一群年輕人失去了記憶，只有生存和逃脫的本能在驅動著他們。他們稱這個地方為“迷宮”。迷宮中有著各種各樣的危險，無論是兇猛的生化怪物，還是不斷變化的墻壁，都在考驗著他們的勇氣與智慧。
主角托馬斯醒來時，四周一片陌生。他被吊著拖了上來，面前是一群同樣迷茫的少年。他們圍繞在一個名為“綠谷”的地方，綠谷是迷宮中央的一塊空地，周圍是高高的石墻，墻上布滿了苔蘚和草木。這里的居民被稱為“格里德”，他們每天都要面對迷宮的挑戰，尋找出路。
托馬斯不記得自己是誰，也不知道為什么會在這里，但他感到一股強烈的沖動，要探索這個地方。他很快結識了小隊的領導者，稱為小指。他是個果斷而充滿魅力的人，負責組織格里德的日常生活。他告訴托馬斯，迷宮每晚都會改變形狀，只有在白天才能安全地探索。傍晚時分，怪物就會從迷宮里出來，吞噬任何迷失的人。
隨著時間的推移，托馬斯逐漸適應了這一切。他參與了一次次的探索，漸漸地成為了小指的得力助手。他與其他格里德建立了深厚的友誼，尤其是與名叫新t的女孩。新t聰明而勇敢，總是為大家提供新的想法和解決方案。她對托馬斯的關注和支持，讓他感到溫暖，也激勵著他更加努力地尋求逃離的方法。
一天，探索團隊發現了迷宮的一個新的出口。然而，值得恐懼的是，出口的外圍是一片黑暗的深淵，令人毛骨悚然。迷宮的龐然大物造訪了他們，格里德們必須迅速做出決定，是待在熟悉的地方，還是冒險嘗試捕獲自由。小指認為應該實時評估風險，而托馬斯則熱切地想要冒險，認為掙脫束縛的時刻已經到來。
在一次充滿懸念的探索中，格里德們遭遇了強大的生化怪物，它們如同夜晚的幽靈，獰笑著向他們逼來。為了保護同伴，托馬斯毫不猶豫地沖了上去，與怪物搏斗。盡管他技藝不精，但他的勇氣和決心感染了所有人。在危機的時刻，迷宮似乎也回應了他們的努力，墻壁開始出現裂縫，似乎要將他們解放出來。
盡管成功擊退了一部分怪物，但托馬斯和他的朋友們依舊處于困境之中。就在他們感到絕望時，驚人的事情發生了。新t告訴大家，她在迷宮中發現了一些線索，指向一個與眾不同的地方，看似通往自由的秘密門。她激勵著每個人，呼喚著希望的聲音，帶著他們重新走向迷宮的深處。
伴隨著越來越多的挑戰，他們終于找到了那扇秘密的門。然而，門前卻是一個令人窒息的考驗，只有完成迷宮給予的任務才能通過。在這場考驗中，托馬斯面臨著內心的掙扎。曾經的孤獨與不安，在此刻重新浮上心頭。但他意識到，在這個被困的世界里，友誼與勇氣是唯一的出路。
經過一番拼搏，托馬斯與團隊齊心協力，終于打開了那扇門。他們意識到，迷宮不只是一個物理的空間，更是對他們內心的一次探索。每個人都在其中尋找著自我，發現著勇氣與希望的力量。隨著大門的開啟，外面的光芒刺眼而溫暖，仿佛迎接著他們的歸來。
最終，托馬斯帶領著他的朋友們走出了迷宮，重見天日。當那道陽光灑落在他們身上時，所有的痛苦與磨難都化作了心底的感動。他們了解到，通過團結與堅持，任何逆境都能被克服。在這個新的世界里，托馬斯不再畏懼未知，反而希望在未來的旅程中，繼續追尋那份光明與自由。