《這個妹妹不太乖》講述的是一個發生在現代校園的青春故事，圍繞著一位平凡的高中生與他的調皮妹妹之間的日常生活展開。故事通過輕松幽默的筆調，展現了兄妹之間深厚的感情，以及成長過程中遇到的各種煩惱與挑戰。
故事的主人公叫李偉，是一名普通的高中生，性格內向，學習成績中等。在他身邊，還有一個活潑可愛的妹妹，名叫李瑤。李瑤性格開朗，調皮搗蛋，總是能夠在平淡的生活中制造出許多意想不到的驚喜與麻煩。雖然李偉對妹妹的種種頑皮行為感到無奈，但他又總是忍不住被她的天真爛漫所感染，常常找到一起玩樂的理由。
故事從一個普通的周末開始，李偉決定利用這個時間補習自己的數學課。他坐在書桌前，眉頭緊鎖，翻閱著厚厚的課本，心中默念著公式。而此時，李瑤正在客廳里興奮地進行一場“科學實驗”。她用家里的材料制造出了一種“自制火箭”，雖然只是簡單的氣球和塑料瓶組合，但在李瑤的眼中，這就是“偉大的科學”。
李偉本來想讓妹妹安靜一些，但看著她那執著的樣子，心中的煩躁逐漸 dissipated。他放下書本，走到客廳，問道：“你在干什么呢，瑤瑤？”
李瑤抬起頭，興奮地回應：“哥哥，我在做火箭實驗！你快來看看！”
李偉無奈又忍俊不禁地笑了，他知道不論自己有多忙，妹妹總能用她獨特的方式來打破沉悶的氛圍。于是，他在一旁觀望著，李瑤一邊忙碌著，一邊講解她的“科學原理”，盡管言之鑿鑿，但也充滿了稚嫩的想象。
隨著一個“嘭”的聲音，李瑤的“火箭”飛了起來，準確無誤地直奔他們家那張剛買不久的沙發。李偉連忙撲過去，生怕沙發被炸到，然而果然不出所料，沙發上留下了一個小小的氣球印。李瑤在一旁捧腹大笑，看來不論是成功還是失敗，她都能找到樂趣。
李偉心中無奈，望著妹妹天真的笑顏，心底暗想，不知道這樣的日子還能持續多久。伴隨著學習的壓力，李偉無時無刻不在思考自己的未來，而李瑤則無憂無慮，享受著每一天的冒險。
隨著問題的堆積，李偉越發感到疲憊，甚至開始對妹妹的“調皮”心生煩躁。他時常會因為瑣事與李瑤發生爭吵，甚至說出一些讓自己后悔的話：”你什么時候才能成熟一點，不要總是這么頑皮？”
李瑤聽了，面露失落，眼中閃爍著微微的淚光，轉身跑了回自己的房間。看著妹妹反應，李偉意識到自己說重了，心里充滿了懊悔。于是，他決定向李瑤道歉，敲了她的房門，柔聲說：“瑤瑤，對不起，哥哥不是那個意思。你能出來嗎？”
李瑤在房間里沉默了一會兒，最終還是打開了門，眼神中雖然有些倔強，但更多的還是對哥哥的依賴。李偉輕聲說道：“你知道嗎，哥哥其實很羨慕你，你可以隨心所欲地做自己喜歡的事情，而我卻要面對很多壓力。”
李瑤聽后，微微一愣，終于明白哥哥其實是為了自己的未來而焦慮。她輕輕擁抱住李偉，用她那稚嫩的聲音說：“那我可以陪你一起努力啊！”
從那天起，李偉和李瑤的關系更加親密。李偉開始嘗試花更多的時間陪伴妹妹，兩人會一起做科學實驗，一起看電影，甚至一起復習功課。李瑤雖然調皮，但每當李偉有困難的時候，她總會用自己的方式來安慰和鼓勵他。
最終，李偉的學習成績逐漸提高，而李瑤也在哥哥的引導下，找到了自己的興趣所在，逐漸開始學習更加系統的科學知識。李偉和李瑤的兄妹情誼在這個過程中變得更加深厚。
歲月流逝，李偉如愿以償地考上了理想的大學，而李瑤也逐漸長大，成為了一個聰明機靈的少女。回首過去，李偉感慨萬千，正是因為有李瑤這樣的妹妹，自己的生活才充滿了樂趣和溫暖。
“這個妹妹不太乖”，其實是生活給予他們的獨特印記，是成長路上相互陪伴、相互理解的印記。在這個過程中，李偉不僅收獲了知識，更收獲了珍貴的家庭情感。在未來無論前路如何，兄妹二人都將攜手并肩，走過一個個春夏秋冬。