在清朝的光輝歲月中，雍正皇帝在權力與欲望之間游走，深邃的宮廷生活總是籠罩在神秘的面紗之下。這個時代對于后宮的女人而言，是一場無休止的角逐。小說《雍正小老婆花妖清穿》，便是在這樣的背景下展開了她的奇妙故事。
主人公小花，是一個現代女孩，因一個偶然的機會穿越到了清朝的雍正年間。她的靈魂寄居在一個名叫小蓮的宮女身上。小蓮是一個美麗而聰慧的女子，卻因為身世卑微，始終處于后宮底層。小花的到來，賦予了小蓮新的生命與力量。她開始用現代的思維和智慧在這個充滿爾虞我詐的宮廷中游刃有余。
小花深知在這個皇宮中，誰能贏得皇上的寵愛，誰就能獲得生存的權利。她努力塑造小蓮的形象，用各種小計謀來吸引雍正的注意。起初，小蓮為了生存只得遵從宮中規矩，但小花的內心卻對這種生活充滿不滿。于是，她在理智與情感的碰撞中，逐漸演變成一個目標明確、心思縝密的女子。
雍正皇帝雖冷酷無情，但內心卻有一絲不為人知的脆弱。小蓮在一次偶然的機會中，救了他的一只傷寵，獲知了皇帝內心深處孤獨的秘密。小花的出現，讓小蓮的性格變得更加活潑、機智，漸漸俘獲了雍正的心。她將現代的理念引入后宮，改變了許多陳舊的規矩，使得皇宮生活煥然一新。
隨著小蓮逐漸得到皇帝的寵愛，她也遭到了其他妃嬪的嫉妒與排擠。后宮之中，暗潮洶涌，一場場明爭暗斗接踵而至。她在一次次斗爭中展現出過人的智慧，采用不同的策略化解危機。小花的靈魂與小蓮的身體產生了神奇的共鳴，令她在危機時刻總能找到出路。
就在小蓮逐步站穩腳跟時，皇宮內部卻發生了一起泄密事件，導致局勢愈發復雜。小蓮面臨著來自外部與內部的雙重壓力，雍正此時對小蓮的信任與感情也受到挑戰。小花意識到，這不僅僅是小蓮個人的生存問題，更是整個宮廷秩序的動蕩。
在小蓮的努力下，她收集了許多有關泄密事件的線索，并將其整理成冊，向雍正呈報。雍正見小蓮不僅聰慧，更有勇氣，于是對她愈發寵愛。在一次正式的朝會上，雍正提到了小蓮的貢獻，令她在后宮中的地位愈加穩固。其他妃嬪雖然心中不忿，然而也無可奈何。
在權力游戲之中，小蓮與雍正之間的感情逐漸升溫。雍正越來越依賴小蓮，而小蓮也在這個過程中感受到了一種從未有過的溫暖。然而，宮女與皇帝的身份差異總讓小蓮心存顧慮。她在糾結與煩惱中，越發思念回到現代的生活。
一個月黑風高的夜晚，一位神秘的女子出現在小蓮面前，自稱是時間的守護者，告知小蓮可以選擇回到現代。但要回去，便要拋棄她現在擁有的一切，包括雍正和后宮的一切。小蓮在內心深處非常猶豫。她回想起現代生活的無憂無慮，和現在的情感，心中五味雜陳。
小蓮知道，若選擇回去，將是對雍正的一種傷害。而留在這里，恰恰是對現代自己的一種放棄。權力的游戲讓她體驗到了人生的另一種色彩，但這背后卻是無盡的孤獨與痛苦。就在小蓮陷入兩難之際，雍正的默默關心與溫暖讓她的內心逐漸傾向于留下。
終于，小蓮做出了決定。她選擇留下，繼續與雍正譜寫一段跨越時空的愛情。她意識到，雖然離開現代的生活讓她失去了很多，但在這個充滿挑戰的世界里，她獲得了真摯的情感與成長。
小說結尾時，小蓮與雍正一同面對后宮的挑戰，攜手共度風雨。他們的愛情超越了身份與地位，成為了后宮中一道璀璨的風景。小蓮的勇敢與智慧不僅改變了自己的命運，也為后宮帶來了一絲新的希望。這樣的結局，讓人感受到穿梭時空的奇妙，以及那份跨越時代的情感，依舊能在歷史長河中激蕩。